| Код НЭИКОН | Организация | Июнь 2011 | Всего 2011 |
| 274 | Государственный университет - Высшая школа экономики | 463 | 2240 |
| 5910 | Северо-Кавказский государственный технический университет | 168 | 1009 |
| 185 | Санкт-Петербургский государственный университет | 89 | 753 |
| 6875 | Государственный научно-исследовательский институт генетики и селекции промышленных микроорганизмов | 157 | 666 |
| 2598 | Институт физиологически активных веществ РАН (ИФАВ РАН) | 71 | 649 |
| 4237 | Научная библиотека МГУ им. Ломоносова | 49 | 618 |
| 4237 | МГУ им. Ломоносова | 49 | 618 |
| 2511 | Библиотека по естественным наукам РАН | 49 | 598 |
| 2565 | Институт биоорганической химии им. академиков М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН | 82 | 562 |
| 403 | Библиотека РАН | 55 | 503 |
| 4237 | МГУ им. Ломоносова | 89 | 451 |
| 2692 | Физико-технический институт им. А.Ф. Иоффе РАН | 18 | 385 |
| 2683 | Институт теоретической и экспериментальной биофизики РАН | 34 | 311 |
| 3242 | Институт цитологии и генетики Сибирского Отделения Российской Академии Наук | 7 | 294 |
| 2715 | Институт клеточного и внутриклеточного симбиоза Уральского отделения Российской академии наук | 63 | 267 |
| 785 | Казанский государственный университет им. В.И.Ульянова-Ленина | 4 | 236 |
| 11723 | Институт биохимии им. А.Н. Баха РАН | 23 | 234 |
| 4439 | Московский городской психолого-педагогический университет | 0 | 219 |
| 3049 | Башкирский государственный аграрный университет | 18 | 192 |
| 657 | Томский государственный университет | 20 | 166 |
| 2699 | Институт теоретической и прикладной механики им. С.А.Христиановича СО РАН | 31 | 163 |
| 530 | Московский энергетический институт (технический университет) | 5 | 158 |
| 2794 | Физический институт им. П.Н.Лебедева РАН | 9 | 148 |
| 301 | Сибирский государственный медицинский университет Федерального агентства по здравоохранению и социальному развитию | 13 | 124 |
| 14757 | Институт экологии и генетики микроорганизмов Уральского отделения Российской академии наук | 1 | 119 |
| 5923 | Институт молекулярной биологии им. В.А.Энгельгардта | 11 | 118 |
| 369 | Европейский Университет в Санкт-Петербурге (Институт) | 5 | 114 |
| 573 | Институт химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН | 16 | 113 |
| 2520 | Институт проблем химической физики РАН | 5 | 113 |
| 223 | Южный федеральный университет | 5 | 109 |
| 156 | Российская государственная библиотека | 1 | 104 |
| 450 | Институт химической физики им. Н.Н.Семенова РАН | 4 | 104 |
| 2483 | Иркутский научный центр СО РАН | 12 | 102 |
| 632 | Ульяновский государственный университет | 0 | 102 |
| 2617 | Институт теплофизики им. С.С.Кутателадзе СО РАН | 0 | 97 |
| 2350 | Вятский государственный университет | 0 | 95 |
| 618 | НИЯУ МИФИ | 2 | 88 |
| 2591 | Красноярский научный центр Сибирского отделения РАН | 4 | 85 |
| 19281 | Уральский федеральный университет имени первого Президента России Б.Н.Ельцина | 15 | 81 |
| 2547 | Институт вычислительного моделирования Сибирского отделения Российской академии наук | 3 | 79 |
| 5901 | Институт общей генетики им. Н.И.Вавилова РАН | 7 | 75 |
| 4231 | Научный центр психического здоровья РАМН | 7 | 72 |
| 4393 | Российский научный центр "Курчатовский институт" | 2 | 69 |
| 2556 | Институт математических проблем биологии РАН | 12 | 66 |
| 2279 | Пермский государственный технический университет | 18 | 64 |
| 4386 | Институт физики полупроводников СО РАН | 9 | 63 |
| 17951 | Всероссийский научно-исследовательский геологический институт им. А.П. Карпинского | 2 | 56 |
| 10198 | Новосибирский государственный медицинский университет | 0 | 51 |
| 1262 | Государственный научный центр вирусологии и биотехнологии "Вектор" Федеральной службы по надзору в сфере защиты прав потребителей и благополучия человека | 0 | 44 |
| 267 | Институт тектоники и геофизики им. Ю.А.Косыгина ДВО РАН | 19 | 41 |
| 2463 | Институт катализа им. Г.К.Борескова СО РАН | 1 | 39 |
| 5962 | Научно-исследовательский институт прикладной акустики | 0 | 39 |
| 790 | Саратовский государственный технический университет | 0 | 22 |
| 271 | Уральский государственный университет им. А.М.Горького | 15 | 21 |
| 4128 | Объединенный институт ядерных исследований | no data | 19 |
| 254 | Алтайская краевая универсальная научная библиотека им. В.Я.Шишкова | 0 | 19 |
| 5764 | Институт органической и физической химии им. А.Е.Арбузова Казанского научного центра РАН | no data | 17 |
| 724 | Биолого-почвенный институт ДВО РАН | no data | 11 |
| 3120 | Тихоокеанский океанологический институт им. В.И.Ильичева ДВО РАН | 0 | 10 |
| 4533 | Институт физико-химических и биологических проблем почвоведения РАН | no data | 10 |
| 1175 | Институт оптики атмосферы им. В.Е. Зуева СО РАН | 0 | 10 |
| 2681 | Институт биофизики клетки РАН | no data | 9 |
| 8941 | Институт механики сплошных сред Уральского отделения Российской Академии наук | no data | 9 |
| 4114 | Социологический институт Российской академии наук | 3 | 9 |
| 2619 | Институт физики твердого тела РАН | no data | 4 |
| 373 | Петрозаводский государственный университет | no data | 0 |
| Всего НЭИКОН | 1819 | 14524 |